强调
小RNA的基因沉默的基因次稳态在不列颠哥伦比亚省温哥华的2月7日至12日举行。我们的客人记者与此活动的通讯员在本地以本地为基础的AthanAsios Zovoilis,该中心是能够避免所有温哥华的自然奇迹,足以与我们分享他的报告。查看一些会议的亮点:
会议概述
顾名思义,会议侧重于小RNA的前景基因沉默。会议计划实际上涵盖了从植物到哺乳动物到真核生物到真核生物的整个基因沉默的整个基因沉默范围,从结构到功能。也许这是会议参与者的主要福利,因为他们可以同时追踪这么多不同的生物,并遵循该领域最近的进步,以获得通过小RNA治理基因沉默的保守机制的更全面的看法。
除了从高度尊重的发言者(其中一些实际上设定了这一新领域的基础)之外,会议还提供了在会议期间和之后与会者之间讨论的机会很大。
主要结论......那里还有很多东西。大多数发言者和参与者都同意我们现在看到的是冰山的尖端,关于小RNA控制蜂窝功能的潜力。
不可避免地,会议包括很多关于mirnas,crrnas和pirnas,因为目前他们包括一些来自最集中和广泛测试的小rnas。然而,大量的会谈,特别是那些被已经提出的海报邀请短暂的会谈,延伸到RNA沉默机器的完全新的,并且可能是替代拼接的意外功能。
此外,本海报还包括许多目前未发表的工作,绝对将在不久的将来制作许多良好出版物的头条新闻。一些触发大量讨论的海报包括:
- Dicer可能会在哺乳动物中可分配不对称RISC载荷
- 小RNA确实在DNA休息修复中发挥作用
- PiRNA可能介导获得性状的转基因遗传,以及C.elegans中的小RNA也可能在转基因表观遗传遗产中发挥作用。(这一点真的引发了参与者之间的大量讨论。)
以下详细描述了这些谈判的一部分:
免疫应答中的Crispr衍生的RNA
詹妮弗Doudna.,UC Berkeley
在她的谈话中,Doudna博士专注于小型Crispr(群集定期间隙的短语重复)的rnas(crrnas)。基于CRRNA的基础免疫系统在原核生物中保护他们的基因组免于入侵外国遗传元素,Doudna的主要问题是该系统如何避免自我靶向。似乎一条短暂的保守序列(PAM)与级联(CRISPR相关的复合物)的成员一起起重要作用。
Doudna提出了一个实验,测试了其中一个成员,Casa的DNA绑定及其在自我识别中的作用。她发现,在Casa Contoration时,DNA结合在Casa Concorporation时,提出了这个问题:为什么CASA是DSDNA结合所需的CASA?Casa晶体结构的阐明表明Casa坐在络合物的底部,靠近种子的位置。通过用Casa的环L1的Casa突变体测试级联组件,她表明,Casa L1与保守序列PAM的靶线相互作用,这对于CRISPR系统至关重要。
人核argonaute致染色质介导的沉默沉默,调节替代剪接。
Annick Harel-Bellan,CEA.
Bellan博士展示了RNAi过程与替代拼接之间有趣的相关性。基于以前的工作,其中她表明,CD44基因的替代外显子由H3K9三甲基化标记的区别,现在她提供了这种标记下面的机制的第一次表征。她在此过程中提出了揭示HP1γ和脾脏成员的关系的数据。此外,还提到映射到外延四肢的RNA。该方法是Dicer,HP1γ依赖性和实验能够表明该机器(称为RNAi分裂)可以影响H3K9三甲基化,CD44和PNA POL II伸长率的替代剪接。
调节microRNA.
Narry Kim.,首尔国立大学
Kim博士描述了她的小组关于单脲酰亚胺化(MONO-U)的作用前体MiRNA在成熟miRNA进一步处理的作用的当前工作。正如她所提到的那样,与研究的多尿嘧啶相反,目前未知,单声道-U的影响是最终的miRNA水平,以及她以Let-7为一个例子的原因。在这种情况下,预先生突出前一3'突出核苷酸的单u-U促进了预雷达的Dicer加工。
为了揭示在该过程中涉及哪种酶,她通过免疫纯化和体外脲化测定来测试人致剂系列的各种成员。辅助酶2,4和7(TUT 7和TUT4对于UTP特异)被证明是单u-U的良好候选者,因为可以引起预雷达7A-1的单声道U和促进Let-7生物发生。从她提出的数据来看,Tut7似乎是主要正在做这项工作的酶。随后,显示Let7单μ-U也依赖于体内Tut-2/4/7。其他示例包括miR-105。基于这些,扬声器得出结论,我们在MiRNA生物发生中具有功能相关性的新型修饰,单脲基化。
沉默因子将异铬胺转录链接到RNA降解
MarcBühler.,fmi.
Bühler博士宣布鉴定了在异铬胺区的RNA降解的已经众所周知的沉默因子。这是SWI6(HP1)。Bühler测试除焦选以外的异铬胺区域。首先,他表明,即使在外出细胞膜被封闭,也没有将来自这些区域转录的RNA(已经被其他研究施加以施加的研究)被翻译成蛋白质,这主要是由于通过HP1结合而转化为蛋白质。显示SWI6通过铰链区结合RNA。他表明,SWI6-RNA结合对于染色体结构完整性可分配。
通过染色体结合蛋白质和Bühler表明,随着RNA结合的增加,将SWI6与H3K9的SWI6的量减少。为此,他提出了一种模型,其中通过通过HP1结合消除由异铬胺区域转录的RNA和HP1结构构象的变化,从染色质(H3K9ME)中释放HP1并转移到外部降解。
系统接近miRNA
大卫巴特,麻省理工学院
Bartel博士通过设定了为什么和MiRNAS与各自的MiRNA歧视的原因和MiRNAS如何以及MiRNA的讨论开始了他的讲话。为了回答这个问题,他在人体细胞中表达了秀丽隐杆线虫(Pri-miRNA)的实验,通常不会进一步加工(在尝试用果蝇miRNA初级成绩单试图这样做时,情况好多)。基于这些发现,他质疑各地区是否有其他决定因素由Drosha和影响原发性转录物加工的相关酶。
他描述了一种通过使用其端部的功能和非功能性PRI-miRNA变体来阐明这种序列决定簇的策略,其端部关闭到圆形构象和随后的大规模平行测序(夹板连接成对结束排序)。基于此,他在上游侧翼区域确定了一种新的CNNC主题,对于加工许多MIRNA来说。该基序也被发现也存在于果蝇中但不是C.Elegans miRNA转录物,这可以解释只有第一个可以在人体细胞中成功加工的原因。
苍蝇和小鼠的piRna途径
Alexei Aravin,加利福尼亚州理工学院亚博pc
博士博士专注于定义PiRNA的基本特征,以及关于他们对其令人难以置信的异质性提出的许多关键问题,例如使PiRNA是一种piRNA,无论我们是否可以创建人工piRNA,还为什么核苷酸序列条件下。使用从交通堵塞3'UTR衍生的PIRNA作为基础并将GFP序列插入盒中,他表明,如果将异源序列插入piRNA簇中,可以产生任何序列的活性人工piRNA。然后他质疑我们是否可以在新的基因组基因座中创建转基因PiRNA。为此,他表明本地和远程序列环境都定义了来自前体转录物的单个PiRNA的产生。
概要
关于原核生物和植物基因沉默机制的结果可能在其他模型系统中非常有用,尽管并不总是适用。但即使它们在有机体之间存在差别(如在巴特博士议案中的情况下),他们也可以帮助确定其监管的新方面。此外,小RNA的潜力似乎延伸到基因表达调节的其他方面,例如替代剪接,RNA沉默机器的玩家似乎与先前认为的功能相比,众多的功能范围。
** Epigenie希望感谢Athanasios Zovoilis博士从加拿大温哥华的基因组科学中心提供此次会议覆盖范围。