突出了
第三届EMBO染色质与表观遗传学会议于2011年6月1日至5日在德国海德堡EMBL(欧洲分子生物学实验室)举行。请查看我们的记者Julia Arand的报道，看看你错过了什么。
大约400家科学家听取了49个会谈，并讨论了233名海报。组织者Asifa Akhtar（MPI，Freiburg，德国），GenevièveAlmouzni（Marie-Curie Institute，巴黎，法国），Ortrun Mittelsten Scheid（Gmi，Wien，Austria），Wolf Reik（Babraham Institute，Cambridge，UK）和Eran Segal（Weizmann Institute，Revohot，以色列）制定了一个伟大的计划，在哺乳动物，植物，无脊椎动物和酵母中的基本表观遗传研究中，多方面概述。除了研究对象的变化外，还有大多数研究人员，关于年龄，国籍和经验 - 许多年轻科学家展示他们的数据的绝佳机会。
环绕双螺旋:EMBO会议关于染色质和表观遗传学系列
这是会议首次在Embl高级培训中心举行;自从两个通道的螺旋向上和内部绕过建筑物的两拔喉部，科学家调查DNA的完美设置。这些“DNA Strands”将游客从建筑物的屋顶上带到景色中。通过沿着“基对”桥来散步，可以从一个螺旋到另一个螺旋。在整个会议期间，海报展示了这些DNA股，当他们想要的时候，与会者可以了解表观遗传学领域的新成就 - 有充足的空间，以便热烈讨论和安静的沉思。陪审团有困难的任务是选择最佳两家海报2333.从PIS和海报中排除了已经发表在科学，自然或细胞中的数据的海报并没有使这个职责更容易。然而，两位选择的获奖者给了令人印象深刻的谈判，并获得了Kindle EBook读者的奖励。
除了固定方案之外，还有足够的时间在休息，海报，午餐，晚餐和啤酒课程中与其他科学家交谈，促进新的和加强旧合作。
尽管有来自著名城堡照明的激烈竞争，但在会议最后一晚的传统派对上，现场音乐演奏的人很多，与会者享受着跳舞、喝酒和聊天的乐趣。
最后还有一个好消息:组委会宣布，这可能不是最后一个关于表观遗传学和染色质的EMBO系列会议!
基因组功能的系统观
乔科·瓦·麦梅梅尔NKI，荷兰
通过使用DAMID分析蛋白质DNA相互作用，它们在果蝇中发现了五种可区分类型的染色质，它们中的每一个具有至少两个独特的相互作用蛋白。
Françoisroudier.CNRS-IBENS、法国
Roudier博士然后将链接到植物基因组，发现四种相关的染色质类型。他与“多细胞真核生物的表观环比具有相似且简单的组织原则”的陈述结束了谈话。
功能基因学
克里斯汀Brogaard美国西北大学
Brogaard博士告诉我们关于将Nucososomes定位在DNA上的新方法。该方法比以前的方法更准确，因为它不采用微核核酸酶处理，其偏好于某些序列。根据这种新方法的核心定位似乎是急剧定义的。观察到只有约10bp的动作。
amos tanayWeizmann Institute，以色列
Tanay博士利用他的体外模型的癌症发展模型，表明“通过随机，平行和逐步过程发生了广泛的DNA高甲基化，该过程不与基因表达或表型选择”。他们计算出每500个CPG和一代约1个CPG获得甲基化。此外，他们不仅声明了基因组中的CPG位置的损失，而且在特定区域中的CPGS的快速增益。
基因表达的控制：转录或未转录
弗雷德伯格淡马锡救生员实验室，新加坡
伯杰博士专注于植物的印迹研究。图示:受精卵后，由于中央细胞基因组的DNA去甲基化，在胚乳中可见印迹。迄今为止，印迹被认为只与CpG相关，因为建立印迹需要DNA去甲基化酶DEMETER和负责CpG甲基化的DNA甲基转移酶Met1的转录失活。Berger现在报告说，依赖RNA的DNA甲基化(RdDM)的不对称性也需要几个位点的印迹。RdDM通路仅在精子中活跃，而在中央细胞中不活跃，与Met1表达类似。
x失活：选择的问题
Joost GribnauErasmus MC，荷兰
格里布诺博士正在分析随机x失活的起始。重要的问题是x染色体是如何计数的?他们发现Rnf12周围的区域对计数很重要。通过在雄性细胞中使用人工的Rnf12位点，这些显示了单个x染色体的失活。他们声称，Rnf12通过激活Xist而在trans中起作用。目前，他们正在寻找相互作用的伴侣，例如发现了由Oct4和Nanog调节的锌指蛋白Rex1。
Maria-Elena Torres-PadillaIGBMC，法国
Torres-Padilla博士侧重于早期小鼠开发期间重复元素的转录和表观学。通过将不同类型的重复元素的转录与卵母细胞相对于胚泡相对于卵母细胞进行比较，它们发现转录的非LTR-RODRORDRANSPOSON的分数增加。然而，总共发现所有元素的转录减少。此外，它们通过芯片寻找不同类型的重复元素的组蛋白修改。对于此分析，它们每次实验收集1200个胚胎！他们发现元素的沉默仅在丢失有源组蛋白修改时关联。他们找不到越来越多的压抑组蛋白标记。
染色质和转录的耦合信号转导
贾恩沃尔特德国萨尔兰大学
本次会议由最近发现基因组 - 5-羟甲基甲基胞嘧啶（5HMC）的第6碱基。沃尔特博士谈到了在精灵中的活性DNA去甲基化。在这个过程中找到5HMC棚的新灯。他的小组表明，TET3将5MC的大部分转化为5HMC。斯特拉/ PGC7保护母体原核中的DNA免受羟基化。此外，它们发现在哺乳动物之间保守了Zygote中的5MC至5HMC转化。
由于5hmC在发育中的明显重要性以及越来越多的数据显示5hmC存在于许多组织中，分析5hmC位置的方法也在进一步发展。
威廉牧师免疫疾病研究所，美国
牧师博士给洞察的方法开发的实验室。他们映射5 hmc ESCs拉5 hmc的衍生品(使用GLIB,添加生物素标记葡萄糖组5 hmc,或识别胞嘧啶5-methylenesulfonate 5 hmc重亚硫酸盐处理后的产物,通过特定的抗体)。这两种方法得到的结果相当相似。他们在ESCs中发现了与二价组蛋白修饰标记(共定位H3K4me3和H3K27me3)相关的启动子广泛存在5hmC。然而，他也提到，最近发表的许多描述5hmC映射的论文包含一些差异。
希望现在将在基对分辨率下建立一个稳健的方法来映射5HMC。如果在DNA模板中存在5HMC，则该技术之一利用PCR减速。Pacific Biosciences序列仪可以测量DNA聚合酶掺入碱所需的时间。为了增加5HMC的放缓效应，它们通过添加葡萄糖分子而扩大羟基组。虽然在体内数据缺失，但体外结果看起来很有希望。
从分子到核建筑
弗朗西斯•斯图尔特技术大学德累斯顿
斯图尔特博士对六哺乳动物H3K4甲基转移酶的功能进行了洞察力。H3K4ME与活性染色质有关。在小鼠的KO实验中，他们发现所有H3K4甲基转移酶都需要适当的发展，每个都有专门的任务。然而，并非所有松散H3K4甲基化的启动子都显示出表达水平的变化。
杰奎琳Mermoud巴布拉罕研究所，英国
相比之下，默尔穆德对与沉默染色质相关的组蛋白修饰很感兴趣，并试图阐明哺乳动物中沉默染色质的维持是如何工作的。他们发现，一种ATP依赖的染色质重塑体SMARCAD1负责组蛋白修饰的维持，而组蛋白修饰与转录沉默的染色质相关。敲除SMARCAD1后，他们观察到组蛋白乙酰化增加，H3K4甲基化和HP1结合减少。此外，他们报告说，SMARCAD1与转录抑制因子如KAP1、组蛋白去乙酰化酶和组蛋白甲基转移酶G9a有关。有趣的是，他们发现SMARCAD1直接与复制机制中的PCNA相互作用，并在复制位点共定位。
基因组稳定性和动力学
PrimoSchär.瑞士巴塞尔大学
Schär博士向我们展示了表观遗传学和DNA修复之间的联系。敲出DNA糖基酶TDG，它们发现了基因组的DNA高甲基化，表明需要TDG以避免或修复不需要的DNA甲基化事件。他们发现TDG在CPG富裕地区的结合。然而，通过敲除TDG，他们观察到CPG差的地区的更多甲基化差异。因此，必须有两个不同的机制TDG如何招募和工作。此外，它们发现组蛋白修饰的变化。因此，DNA修复事件和维持表观蛋白酶是密切相关的机制。
克雷格Pikaard.印第安纳大学美国
Pikaard博士可以令人信服地显示出优雅的测定，即两种植物特异性的RNA聚合酶IV和V在siRNA介导的DNA甲基化和沉默中具有非冗余功能，具有实际的聚合酶活性。他进一步证明，POL IV用RNA依赖性RNA聚合酶携手并配合在一起，两者一起生产那些是用于小RNA产生的底物的双链RNA。
全体讲座
博克同行Embl，海德堡
在昨晚，宴会和党博士不久，Bork博士讲述了全体会议。他介绍了一个“可爱的小而易于管理的体内模型系统，可以廉价地研究” - 细菌。分析人类肠道中的DNA，他的小组可以识别超过4,000,000个细菌基因。与血型差异类似，根据生活在他们的肠道的细菌的情况下，人类可以分为三种不同的类型。表观遗传学家似乎喜欢瞥见不同的纪律，并听到一个让它成为许多流行报纸的故事。
** Epigenie想感谢Julia Arand，Dipl。BIOL。，德国萨尔兰州大学遗传学/表观遗传学部的遗传学/表观遗传学部门提供了此次会议的覆盖范围。