强调
新鲜的Cayman Island海滩，了解阿吸管的染色质谱和函数2013年约翰霍普金斯大学艾莉森····普罗丝的覆盖范围
会议摘要
自2004年以来，阿吸阿姆姆与剑桥大学古龙学院副主任Tony Kouzarides合作，以举办其“染色质结构和功能”会议。在11月（2013年11月11日）的月份（2013年11月11日），会议在最温暖和最热带地区举行，就像我们北半球的那些人那样习惯了寒冷的秋风的愤怒。我很幸运能够进入大开曼岛的大开曼岛，其中150多名世界领先的染色质研究人员，该研究人员在该系列中的第七次会议。
会议场地是七里海滩的水边的华丽度假胜地，这是岛屿西侧的热带天堂。“你可以做科学，同时玩得开心！”托尼敦促在会议的开幕式会议上，他确保会议参与者参加了他的建议。在会议的最后一个晚上，托尼将外面的讲座搬到了游泳池之外！当Kristian Helin用池畔投影仪系统踢出会话时，我们坐在水中悬挂在水中。这里是众多令人兴奋的谈判中的一些摘要。
染色质变化真核衰老和癌症
宾夕法尼亚大学Shelley Berger
Shelley Berger与我们的新周围环境，风景如画的Cayman热带景观有关，以细胞衰老的表观遗传“景观”。衰老是据信促进组织老化和肿瘤抑制的细胞分裂。Berger的组最近与增殖和衰老人细胞之间的组蛋白修饰进行了比较，发现各种基因组的景观中的显着差异。在衰老细胞中，与增殖细胞相比，该团队鉴定了富含H3K4ME3和H3K4ME3和H3K27ME3（“MESAS”）的区域和在H3K27ME3（“峡谷”）中耗尽的区域。有趣的是，发现MESAS在Lamin B1相关的染色质结构域形成。核叠层在核膜内部线并辅助核形状和DNA复制。
使用ShRNA在增殖细胞中敲蛋白B1，该组证明了Lamin B1耗竭引起的衰老，并且存在于衰老对照细胞中存在的H3K4ME3 MESAS，H3K27ME3 MESAS，H3K27ME3 MESAS和H3K37ME3峡谷中存在于这些层林B1耗尽细胞中。Hutchinson-Gilford Progeria综合征的细胞模型，由Lamin A突变引起的加速老化障碍，也显示了富含富含髓鞘。这些结论具有LED BERGER和她的小组对Lamin B1在衰老中的下调和其相关的染色质变化的变化变得越来越感兴趣，这可以涉及老化和癌症。
重塑重塑剂：致癌物质复合物
Cigall Kadoch，斯坦福大学医学院
Cigall Kadoch和她的博士后顾问Gerald Crabtree，两者都在MSWI / SNF（BAF）复合物上发表了令人兴奋的谈判，这主要是一组蛋白质，这些蛋白质可以改造Chromatin如何包装。该复杂性具有重大影响癌症，因为kadoch发现约20％的人类癌症在至少一个BAF亚基中表现出突变。她最近发现，由易位产生的SS18-SSX1融合蛋白是人类滑膜肉瘤的标志，与BAF复合物结合并改变它们的组成。
另外，与对照细胞系相比，滑膜肉瘤细胞表现出肿瘤抑制亚基BAF47的较低表达。在进一步研究引起癌症突变背后的机制后，Kadoch发现，BAF复合体组合物中的这些改变导致除去H3K27ME3抑制和活化多能因因子Sox2，其推动细胞增殖。有趣的是，通过减少SS18-SSX水平或通过增加野生型SS18水平来逆转该现象。这些迷人的调查结果指向一种新的潜在癌症治疗目标。
组蛋白H2B甲基化 - 可转换元素的监护
罗伯特施奈德，Igbmc，法国
Robert Schneider指出，虽然巨大的研究表征了组蛋白H3和H4的修饰，但研究了H2A和H2B的修饰得多。因此，他的研究目标是鉴定新的组蛋白修饰并确定其在疾病过程中的作用。具体而言，他的组最近鉴定了一种新型组蛋白H2B甲基化。在开发和表征定制抗体以检测H2B的单甲基和二甲基化之后，它们筛选甲基化酶并鉴定的PMT2，这是一种新的甲基转移酶。γ-H2AX测定标记DNA损伤表明PMT2耗竭增加了基因组不稳定性。另外，在结肠癌中显示H2B的单甲基化和D-甲基化。总体而言，该工作建立了H2B甲基化作为基因组完整性的关键调节因子，并打开潜在的新癌症疗法的可能性。
单细胞，染色体，分子和基础水平的CIS基因调节
宾夕法尼亚大学Arjun Raj
Arjun Raj以他的Lab Group的工作描述最简单的描述：“我们制作工具可视化细胞中的基因表达。”然后，他用细胞核中的单分子RNA可视化的美丽，充满活力的图像炫耀我们。一个2008年自然方法来自RAJ组的出版物介绍了一种原位杂交方法，称为“单分子RNA鱼”，其使固定细胞中单个mRNA分子的荧光可视化能够。最近，该组研究了如何将基因组织到染色体中影响基因表达。
它们在原来的方法上开发了一种新的旋转，这次称为“内含子染色体表达鱼”（冰鱼），其使用寡核苷酸荧光地标记内含子，以便同时测量和涉及染色体结构的基因表达。它们使用该方法沿人包皮成纤维细胞鉴定型染色体19的20个基因，然后检查一个基因的转录状态是否受到同一染色体上另一个基因的转录状态的影响。虽然这20个基因中的大多数表达关系显示出任何相关性的低可能性，一对基因，RPS19和ZNF444，表现出了一个公平的反形。他们发现缺乏特定的反形状其他染色体19，表明基因之间的相互作用是aCIS.局限于单个染色体。在HeLa细胞中观察到相同的相互作用模式。Raj的单细胞和单分子方法无疑是越来越强大的工具，以研究基因表达的固有变异性。
外带
显然，本会议的热门话题包括染色质结构和衰老功能的重要作用。探讨了新发现的和较小的表观遗传修饰，例如罗伯特施奈德和H3苏氨酸118磷酸化的H2B甲基化由Jessica Tyler（MD Anderson癌症中心）磷酸化。非编码RNA也常常通过会议常规讨论，例如John Rinn和Robert Kingston（哈佛大学）。过去几年在染色质研究中带来了巨大的进展，并希望这些令人兴奋的调查结果将继续引导我们对疾病的洞察力和治疗可能性。
*** Epigenie希望感谢和大喊大叫艾莉森········普米斯，以便在提供此会议覆盖范围的“肮脏的工作”。艾莉森是在约翰霍普金斯大学的化学与生物分子工程系和纳米生物科学研究所的Denis Wirtz的博士候选人。亚博pc