突出了
另一个重要的楔石事件拉开了春季会议季的序幕,内布拉斯加大学医学中心的凯瑟琳·穆拉里-坎蒂在那里感受了这一切。看看她的报道,看看发生了什么:
这次研讨会在圣达菲举行,吸引了大多数表观遗传学领域的学术中肯人士,以及一些来自制药公司的代表,如葛兰素史克、Celgene等。会议中心位于圣达菲市中心,允许Keystone的两组讨论会同时在那里举行。第一季是癌症表观遗传学会议,第二季是转录调控会议。联合会议在主会议室有大约500人出席。晚上晚些时候,海报会议被安排在相邻的会议室里,还有一个开放的酒吧,三天里每天都有大量的开胃菜。我发现以下的演讲对我来说非常有趣,因为它们的内容和呈现方式:
染色质结构和功能的化学调制
詹姆斯E. Bradner.达纳法伯癌症研究所
以身处新墨西哥州为主题,詹姆斯以《绝命毒师》(Breaking Bromodomain)中典型的充满烟雾的绿色字母开始了他的演讲,但他的标题幻灯片上写着,打破溴域和额外的终端赌注。布莱德博士首先解释了癌症是一种超级增强子的疾病,以及表观遗传标记的读者是如何进化保守的,并识别组蛋白赖氨酸尾部的修改。
BRD4是BET家族的一员,对转录延伸至关重要,参与了正转录延伸因子复合物(P-TEFb)的招募。BRD4是侵袭性人鳞状癌复发性t(15;19)染色体易位的重要组成部分。含有BRD4-NUT(睾丸核蛋白)癌蛋白的细胞系具有增殖优势和分化障碍。BRD4- nut癌蛋白的BRD4的Kac结合位点,Bradner lab开发出JQ1抑制BRD4,并通过多种实验得到了很好的证明。实验证明,这种抑制作用能够诱导细胞分化和生长停滞。JQ1的抗肿瘤作用在异种移植标本中也得到了证实。JQ1是BET家族抑制剂中的一类。
在布莱德博士讨论了他的科学之后,他讨论了他如何希望科学成为一个协作的行业,而不是“我和我”的研究。布莱德提到,他愿意免费提供1克他新发明的药物,不需要任何致谢或作者。然而,仍然有一些人从不同的公司购买药物,他非常努力地说,科学越合作,对后代越好。鉴于Bradner的新教员职位和他的实验室才建立了三年,他的演讲受到了很好的欢迎。
癌症的细胞代谢和表观遗传变化
克雷格·b·汤普森纪念斯隆-凯特琳癌症中心
为了抛出有趣的话题,汤普森博士一般地花了很多关于代谢在表观遗传学中的作用。组蛋白乙酰转移酶(帽子)将乙酰COA的乙酰基转移到组蛋白的赖氨酸残基中,并产生COA作为由身体代谢的乙酰COA制成的乙酰COA,将主要代谢单元成为组蛋白乙酰化。组蛋白脱乙酰化由热量限制调节,因为在低营养存在下,SIRT1水平降低。组蛋白甲基化通常导致沉默是一种非常能需要过程的基因。然而,肿瘤细胞仍然宁愿使用组蛋白甲基化以引起许多肿瘤抑制基因的沉默。细胞可以与乙酰化或脱乙酰化或甲基化接合的程度依赖于电池利用葡萄糖。
汤普森接着以代谢酶异柠檬酸脱氢酶1 (IDH1)为例,它将NADPH转移到细胞质中。IDH1在细胞质和线粒体中分别转化异柠檬酸和α-酮戊二酸(α-KG)。IDH1在各种神经胶质瘤、成人急性髓细胞白血病(AMLs)中经常发生突变,导致功能丧失、错义、活性位点错误,这只发生在与异柠檬酸结合所需的氨基酸中。突变体IDH1导致α-KG转化为2-羟基戊二酸(2-HG),这种新代谢物的高水平在AML患者中通常高达100倍。在互排性IDH突变的患者样本中发现了TET2突变,这种TET2突变和IDH突变的功能缺失阻碍了TET2-诱导的5-羟甲基胞嘧啶的增加。Thompson还讨论了2-HG的积累和TET2的丢失的联合作用如何导致共同的骨髓祖细胞的阻滞。Thompson提到药物AGI-6780能有效选择性地抑制肿瘤相关IDH1/2。所有这些都表明了细胞代谢如何在表观遗传调节因子的调节中发挥如此重要的作用。
癌症中CpG岛甲基化的触发因素是什么?
苏珊·j·克拉克美国加文医学研究所
我喜欢这次演讲,因为我相信Clark博士做得非常好,他一步一步地展示了他们是如何了解到是什么触发了癌细胞中肿瘤抑制基因的高甲基化的。为此,Clark研究了与谷胱甘肽s -转移酶(GSTP1)基因相关的CpG岛,该基因在前列腺肿瘤中是高甲基化的,但在正常前列腺细胞中是完全未甲基化的。
他们提出的第一个问题是,GSTP1基因序列本身是否有什么东西使其易受高甲基化的影响,为了证实这一点,他们将正常的GSTP1基因序列转染到LNCaP细胞中,但即使经过22次传代,该基因序列仍未被甲基化。然后,他们想测试活跃的转录是否能保护CpG位点免受高甲基化的影响,但事实并非如此。他们还发现,如果CpG岛周围的边界元素被移除,或者如果基因在更早的时候被沉默,它不会影响高甲基化。然后提出了“播种和沉默:引发甲基化”模式,他们建议2事件发生在组合包括一个特定基因的失活和随机CpG岛甲基化的“种子”,最终将作为触发进一步从头甲基化。在失活基因中观察到的低水平甲基化(通过致癌的独立过程)足以促进高甲基化,并允许甲基化结合蛋白(如MBD2)的结合。
Clark的实验室通过一系列实验证实,与沉默启动子相关的是MBD2而不是McCP2。他们发现,在癌细胞中,MBD2可以与低水平甲基化的细胞(种子)结合,并在DNMTs和HDACs的帮助下,在新生甲基化中发挥作用。她继续证明MBD2不仅是甲基化的解读器,而且在定义DNA高甲基化特异性方面起着关键作用。
**EpiGenie想送一个大大的“谢谢!”感谢内布拉斯加州大学医学中心Eppley系Michael G. braton(博士)实验室的博士候选人Catherine Murari-Kanti提供了这份会议报告