突出了
如果你去不了也不用担心2015年美国细胞生物学学会会议- Epigenie会支持你的。我们拿着我们能找到的最舒适的鞋子,忍受着站着走着,吃着咸味的会议零食,这样你就不用吃了。我们在会场里搜寻着我们能找到的最尖端的合成生物学。亚博赞助阿根廷亚博博彩以下是我们看到的:
CRISPR-CAS基因组监测:从基本生物学到转型技术亚博pc
詹妮弗Doudna|加利福尼亚大学伯克利大学
是的,我们正以CRISPR为先导。syn生物会议也是如此。CRISPR技术的两位关键人物是詹妮弗·杜德纳(Jennifer 亚博pcDoudna)和冯峥;詹妮弗Doudna在现场讲述CRISPR的起源故事。她第一次看到CRISPR是在吉莉安·班菲尔德(Jillian Banfield)向她寻求帮助时,她对细菌基因组中的这一奇怪特征感到困惑……
很多基因组都有神秘的簇,有规律地穿插着病毒DNA,通常是回文的,重复数十到数百次。它们看起来一定很重要,但它们不是蛋白质编码。作为一名RNA专家,詹妮弗认为它们一定是在RNA水平上发挥作用。
当然,随着该领域的发展,CRISPRs确实产生了引导Cas蛋白靶向病毒DNA的rna,为细菌提供获得性和遗传免疫。詹妮弗的实验室很快意识到,他们可以通过提供针对任何DNA序列的crRNA来破解这个系统。一旦他们能切割特定的序列,他们就可以用这种技术高度特异性基因组编辑,产卵迅速爆炸现场我们现在看到了。
该实验室最近的研究可视化了主要CRISPR蛋白Cas9在真核细胞核内的搜索动态。在一些很酷的电影中,她展示了把Cas9定位到特定的DNA序列可以实时地告诉你那部分基因组在太空中的确切位置。他们还研究了更高效的Cas9递送,显示预组装的Cas9- grna复合物工作迅速,在其工作完成后迅速消失(从而减少脱靶效应),并与共转染的DNA修复模板一起工作,以实现同源定向修复。
使用于能源、环境和医药的材料有了新的生机
安吉拉·贝尔彻|马萨诸塞州理工大学,剑桥,美国亚博pc
安吉拉·贝尔彻又做了一个很酷的演讲,重点是我们称之为超纳米生物病毒材料工程的东西。这听起来很复杂,但主要思想却很有意义。生命进化出了一些非常神奇的材料,从超级坚固的鲍鱼贝壳到发明了玻璃的微小硅藻。生物模板的结晶无机材料非常精确,纳米尺度的模式。除了它们令人惊叹的产品,鲍鱼和硅藻的伟大之处在于,亚博电话客服它们在友好的温度和压力下工作,不产生有毒废物。如果我们能够利用这个过程,也许我们可以用它来制造纳米结构的材料。
如果生活可以为我们培育更好的电池,而不是超级强大的贝壳呢?By N yotarou (N yotarou) [GFDL,cc-by-sa-3.0或者CC 2.5),通过维基共享
然而,不幸的是,生物学还没有进化到与我们在技术中使用的半导体和金属有太大关系。亚博pc安吉拉的实验室利用噬菌体展示技术,通过进化肽序列来结合金、铂或其他小分子来解决这个问题。通过在噬菌体外壳蛋白中表达这些多肽,它们可以模板像镀铂的金纳米线、用于更大容量电池的金/钴氧化物电极、用于更高效太阳能电池的碳纳米管电子指南,以及用于生物燃料生产的更好的纳米催化剂等东西。
回到生物学上来,他们甚至制造了靶向肿瘤的噬菌体。这就提供了足够的影像对比,可以显示出微小的肿瘤,否则就太小看不见了,这有助于外科医生发现并移除它们。
无扩散的图灵模式形成
近藤滋日本大阪大阪大学|
大多数倾向于合成的生物学家都对隐藏在他们灵魂深处的图灵模式情有独钟。图灵模式是由因破译纳粹密码和人工智能而闻名的艾伦·图灵提出的,对于数学生物学家来说,图灵模式一直是解释斑点和条纹等生物模式的白色独角兽。主要的想法是,例如,如果光电池有近距离的正反馈回路和远距离的负反馈回路,你就可以得到光条纹。局部的正反馈帮助一个光圈被一群其他光圈包围,而较长的负反馈回路则确保光圈被黑暗的光圈包围。
这个理论在计算机模拟中很有效,但在真实的生物学中却很难证明。近藤滋然而,他在斑马鱼身上展示了一个非常优雅的图灵图案。传统上认为,正负反馈的短期和长期范围是由不同的扩散速度引起的。相反,Shigeru指出斑马鱼是通过色素细胞的长短突起来实现长度上的差异的。浅色细胞的树突很短,要么很冷,要么很尖,因为它们会让深色细胞在接触到它们的地方逃跑。这留下了光条纹。然而,光细胞也有较长的突起,这实际上有助于暗细胞的生存,通过delta-notch通路,它包围了光带与暗带,因此条纹。
这个演讲很酷,因为它最终证明了一个长期预测的模式形成模型是正确的,只有一个关键区别。这些图案不是通过快速或缓慢扩散的化学物质形成的,而是通过物理接触形成的,使用长短手指产生相反的效果。使用工程式CRISPR / CAS9的正交和模块化基因调节
安德烈Didovyk美国加州大学圣地亚哥分校
Andriy Didovyk展示了CRISPR在合成基因网络中的能力正交库,启动子元素使用定制设计、飞行测试的CRISPR目标。启动子元件可以被不同的gRNAs单独控制,甚至可以与其他调控元件混合匹配。这解决了合成生物学长期以来的一个限制——人们真正能用来构建电路的“开关”只有几个,亚博赞助阿根廷亚博博彩到目前为止,这使得基因电路只有几个活动部件。
重组化学诱导二聚体系统作为巨大脂质体潜在的人工趋化感应机制
湿婆哈|约翰霍普金斯大学,美国博尔的摩,美国
另一个长期存在的挑战是真核生物的趋化性;即。,白细胞如何捕获细菌?Shiva Razavi通过制作来描述与Takanari Inoue一起解决这个问题能与雷帕霉素发生化学反应的合成囊泡。
他们从使这项工作在真实细胞中,两种肽在暴露于雷帕霉素时二聚体。一个锚定膜,另一个被融合给RAC的活化剂,这会诱导细胞偏振。雷帕霉素使两种肽二聚体将Rac活化剂拉到细胞皮层上,使活细胞实际上朝向具有更高的雷帕霉素的地区爬行!它们具有在合成囊泡中工作的雷帕霉素诱导的膜定位,并且它们向下工作,以实际制造合成的趋化性囊泡。
生成体外老年皮肤
Paula Pennacchi |圣保罗大学巴西
在圣迭戈的阳光下受苦之后,我们很高兴地看到葆拉·彭那奇,与Silvya Stuchi Maria-Engler他发现了一种很好的合成物皮肤老化模型-关键是表皮I型胶原的糖基化。
CRISPR/Cas9介导的哺乳动物细胞工程的DNA、RNA和RNP传递方法的优化
Chuenchanok Khodthong|Mirus Bio LLC,麦迪逊,威廉,美国
Chuenchanok Khodthong与Mirus生物评估了在哺乳动物细胞中导入CRISPR/Cas9基因编辑的不同方法。结果是,没有一种方法一定是最好的;转染质粒DNA编码cas9加上自定义sgRNA是最简单的转染cas9信使rna + sgRNA可能更有效,转染预组装的Cas9蛋白-sgRNA复合物(核糖核蛋白,或RNP)对不合作的细胞更有效。
使用合成的crRNA和tracrRNA与单链Oligos进行同源定向修复
詹姆斯GoldmeyerGE医疗保健,Lafayette, CO, USA
James Goldmeyer检查了使用单链(SSDNA)寡核苷酸作为模板在CRISPR靶向后使用单链(SSDNA)寡核苷酸的疗效。在U-2 OS细胞中,寡核苷酸在2.5-10nm工作。20-70 BP的同源臂全部工作大致相同(15%-RECHERCHED HDR),但10个BP同源臂太短。
利用缓步类植物研究植物脱水耐受性的机理及应用
托马斯Boothby北卡罗来纳大学,教堂山,美国
并用完全不同的东西完成它,托马斯Boothby在缓步类动物(微小、坚不可摧、能在真空环境中生存的八条腿软糖熊)中确定的基因帮助它们能很好地忍受干燥。将这些基因转移到酵母或细菌中可以使细胞对干燥的抵抗力提高10-100倍!这可能有助于制造更稳定的疫苗或耐旱作物。

缓步动物:关于我们在会议结束时的感受,除了有点不耐干燥。作者:Bob Goldstein, Vicky Madden, UNC Chapel Hill [cc by-sa 3.0]