突出了
4TH.加拿大外观遗传学会议：“疾病机制”发生在11月26日至29日TH.2017年在美丽的惠斯勒，不列颠哥伦比亚省，加拿大。与会者有190人，其中88人是学员。这次会议鼓励提出新的数据，合作和研究人员之间的讨论。雪花纷飞，每顿饭都吃熏鲑鱼。如果你错过了，5TH.加拿大外观遗传学会议将于9月30日出发TH.10月3理查德·道金斯2018年，在加拿大魁北克省埃斯特尔的埃斯特尔度假村。
在对死者的感人贡献致敬之后丹尼斯巴洛对于Lncrna领域，主题演讲者Anne Ferguson Smith介绍了蓝图表观群落项目。蓝图使用多种鼠标菌株，细胞类型和性别来比较RNA-SEQ，WGBS，OXWGBS，芯片SEQ组蛋白甲基化和乙酰化数据集重点放在造血系统上。它旨在将单细胞外观蛋白酶数据与转录组和蛋白质组数据集整合。
高吞吐量外延型测绘
来自新加坡基因组研究所的Shyam Prabhakar共享持续的工作芯片SEQ.在自闭症中的组蛋白乙酰化 - 宽协会研究中。与RNA-SEQ数据和Daniel H.Gerschwind的Jonathan Mill合作进行DNA甲基化数据，它们在冷冻后验尸脑样品中发现了5000多种不同的组酮乙酰化峰。Prabhakar博士还在结核病队列中分享工作，其中已经发现了与表达和组蛋白乙酰化的新型联接。
接下来，英格兰国王大学伦敦的Jordana Bell分享了使用Illumina 450k和Epic阵列的双胞胎中DNA甲基化的工作。她发现大约10％的甲膜是高度遗传的。增强剂和绝缘体甲基化更遗传，而启动子甲基化是最不可遗传的。
来自加拿大西蒙弗雷泽大学的Maxwell Libbrecht介绍了Segway百科全书的人类监管要素。他们的小组开发了一种模式发现算法，并从164种人细胞类型应用于1615种范围的基因组测定编码项目预测没有任何内容的基因组区域先验注释。因此，它有潜力识别目前未知的基因组元素。百科全书注释了非活跃区域，构成异染色质的永久沉默区域标记为H3K9ME3.，具有细胞类型特异性抑制的兼性异染色质H3K27ME3.，转录的地区，启动子，增强剂，具有弱活动的允许区域，如H3K4ME1.，具有激活和镇压标记的二价区，以及其他低置信区。Libbrecht博士的工作也是如此文章预印刷品。
来自医院的生病儿童（多伦多，加拿大）的Eric Campos分享了他的工作，就通过细胞周期保持了组织标记如何。Campos博士讨论了无需修饰的新组蛋白是在复制叉上的ASF1和CAF-1伴侣，而较旧的组蛋白在引导和滞后的股线之间被隔离，尽管确切的机制仍然未知。他建议，真核复制氦CMG可以用组蛋白结合结构域和事实组蛋白介导，尽管需要做更多的工作。
发育外形组法规
来自英国哥伦比亚大学的Wendy Robinson（加拿大Vancouver，加拿大）强调了胎盘作为妊娠并发症的介质，这些因素产生的妊娠并发症。罗宾逊博士比癌症DNA甲基化更多地比典型的体细胞更加癌症，肿瘤抑制剂的高甲基化和癌基因的低甲基化。然而，她指出，很多胎盘变异性仍然支持健康的胎儿发展。另外，在母体血液中发现无细胞胎盘DNA。罗宾逊博士发现了48个差异甲基化区域，与基因表达下降相关，但是她的景点已经集成了与多个OMIC数据相结合，以识别亚型和相关标记与更健康的母亲和婴儿的目标。
来自麦吉尔大学的Jacquetta Trasler（加拿大蒙特利尔，QC，加拿大）描述了她在DNA甲基化和父亲叶酸的工作。低水平的父亲叶酸导致改变的精子外延蛋白，患阴性妊娠结果增加。即使甲基化的微小变化也可能具有严重的后果。通常，精子甲基叶片在个体之间和随时间之间非常稳定。兴趣是叶酸途径中的MTHFR - 一种常见的多态性与细胞活性降低和一些不孕症有关。使用鼠标模型，Trasler博士和她的团队已经观察到DNA低甲基化后叶酸补充裂缝和MTHFR缺乏小鼠。几代人，F1小鼠中有少量精子，具有F2死亡率。
马萨诸塞大学阿姆赫斯特分校的理查德·皮尔森分享了他关于高龄父亲的研究。比尔森博士的实验室研究了父亲年龄与精子发育和DNA甲基化之间的关系。为此，他发起了精子环境表观遗传学和发育研究(seed)。通过这项研究，比尔森博士发现年龄的增加与生育能力下降和胚胎质量下降相关。DNA甲基化会随着年龄的增长而增加，Richard建议，仅仅10个CpG就可以解释高达94%的年龄差异，而20个CpG位点就足以准确预测年龄。
来自蒙特雷尔大学（蒙特利尔，QC，加拿大蒙特利尔，QC）的Serge McGraw解释了他在早期胚胎酒精暴露的工作。麦芽渣博士在8细胞阶段乙醇注射，能够在胚胎第10.5天通过前脑和胎盘中的RRBS看到DNA甲基化的持续变化。通过胚胎第18.5天，造成更多伤害以性别特异性的方式积累。
细胞通过组蛋白密码发出信号
来自科罗拉多大学的Tatiana Kutateladze讨论了组蛋白修饰的大量的表观遗传读者。具体来说，她专注于与特定的组蛋白修饰结合的PHD手指。她解开了一些绑定的复杂性，需要多个顺序读取器结构域或组合二价相互作用她的实验室描述的。
来自渥太华大学(Ottawa, ON, Canada)的Jean-Francois Couture介绍了他对组蛋白(特别是赖氨酸甲基转移酶的SET1家族)翻译后修饰的研究。在许多与SET1 (COMPASS)相关的疾病(尤其是癌症)中，Couture博士发现SET1的催化活性需要各种对组蛋白甲基化活性至关重要的COMPASS支持蛋白。
宾夕法尼亚大学本杰明·加西亚实验室的Simone Sidoli分享了他们关于组蛋白修饰分析的重叠蛋白质组学和代谢组学数据的研究成果。Sidoli博士讨论组蛋白的“自下而上”质谱寻找罕见的后期修改。此外，Sidoli博士提到了将芯片-SEQ和ATAC-SEQ数据重叠为特征的能力，以表征组蛋白修改。
表观蛋白扰动在疾病中的机制
来自加拿大多伦多儿童医院的Rosanna Weksberg介绍了她在DNA甲基化和孟德尔疾病方面的开创性工作。她描述了一系列与表观基因有关的智力残疾综合症。许多与神经发育综合征相关的基因都与表观遗传调控有关。例如,NSD1甲基转移酶突变后的Sotos综合征。结果，这些病人会看到大量的DNA甲基化缺失。使用来自450K序列的甲基化签名，未知意义的变异被自信地称为Sotos综合征。Weaver综合征在临床上与Sotos相似，但Weksberg实验室已经能够根据Sotos NSD1特征和Weaver综合征患者EZH2(组蛋白赖氨酸甲基转移酶)的特定甲基化特征来区分它们。同样的,歌舞伎和电荷综合症有很高的临床重叠，但有独特的DNA甲基化谱，特别是KMTZD，一种组蛋白赖氨酸甲基转移酶，用于歌舞伎综合征和CHD7，一种色域解旋酶DNA结合蛋白，用于电荷综合征。Weksberg博士通过提交患者数据邀请合作，进一步描述表观基因突变，这些突变需要已知的致病突变和可靠的表型数据。
来自多伦多大学（加拿大多伦多）的Jennifer Mitchell描述了她对增强剂突变和疾病的工作，从而即使单一的核苷酸差异足以用于负表型。她使用关联与转录因子预测来自已知启动子区域的增强剂。具体而言，Mitchell博士发现了一个增强器集群，下游约100 kBSox2与转录因子大量相关，现在被称为超级增强剂。她的工作现在专注于通过使用CRISPR / CAS9系统的目标删除来关注这些位置的冗余和效力。
表观遗传学在癌症
在整个会议中谈论ePigenetics如何在癌症中发挥作用。首先，来自加利福尼亚大学旧金山的Joe Costello介绍了他对IDH1突变胶质瘤脑肿瘤的作品。这些突变产生柠檬酸循环的抑制底物，称为Oncometabolites。IDH1生成作为A字母表的alphaketoglutarateTET蛋白质基质，其破坏导致DNA甲基化的积累。通常存在来自初始IDH1的突变积累，导致表观遗传和代谢重编程，其次是另外的p53和ATRX突变。即使随后在IDH1突变状态下变化，初始甲基化变化也使细胞稳定，使甲基化分布延伸。
来自麦吉尔大学的Jacek Majewski（蒙特利尔，QC，加拿大）将Joe Costello的调查扩展到儿童中发生的成人胶质瘤。对于Majewski博士，似乎在组蛋白亚单位H3中似乎是鉴定许多组蛋白修饰基因。通过Majewski博士的研究，他发现了H3K36ME3.似乎是基因体中的沉默标记，其中招募DNA甲基化。
多伦多大学的Mathieu Lupien概述了他的研究的三个细节。首先，他的实验室研究了肾上腺素改变是如何影响癌症发展的。其次，卢皮恩博士和他的团队研究了表观遗传学与癌症基因发现的重叠。最后，卢皮恩博士想知道肿瘤代谢是如何改变表观基因组的。Lupien实验室的重点一直是DNA和组蛋白甲基化，因为肿瘤的代谢适应导致了改变的SAM，即通用的甲基供体。Lupien博士发现了大型有组织的染色质赖氨酸结构域(LOCKs)H3K27ME3.信号在对化疗药物紫杉醇耐药的突变群体中积累。锁也与DNA甲基化降低有关，并富集重复元素，而不是基因。卢皮恩博士认为，当萨姆减少这些重复元素时，细胞可以通过添加组蛋白锁来抑制这些区域而存活。
Marco Gallo来自卡尔加里大学（Calgary，AB，加拿大）讨论了他的胶质母细胞瘤的患者衍生的模型。Gallo Lab致力于了解组蛋白变体如何在层次结构或致陀奈尼潜力中发挥作用以及3D基因组结构的作用。与其他可用数据集相比，Gallo博士发现H2A2信使RNA的表达下降。另外，增加的H 2 A 2转录物拮抗胶质细胞母细胞瘤的自我更新。H2A2的敲低导致浓缩染色质的核扩展。使用HI-C与芯片-SEQ检查相结合H3K27ac，Gallo实验室已经能够在其他染色体的臂上找到超级增强剂，以及Glioblastomas的其他重要组织变化。
数据可视化
来自加拿大迈克尔史密斯基因组科学中心的马丁克尔兹·斯基斯（加拿大卑诗省温哥华，加拿大）举办了一个研讨会数据可视化那是一个拳打。他在展示时旋转了海报，发现他提出了自己的改进。这个教育为每个人，也有点羞辱。马丁解释了大屠杀原则，强调我们在看看数字时，我们会在空间上看到音调。他解释了我们如何隔离我们的数据所显示的本质，并尽量减少多余信息。马丁推荐使用Brewer调色板对于比默认RBG方案更吸引人的颜色方案。他还推荐使用心烦意乱在重叠多个数据集时代替Venn图。
感谢Bonnie Alberry编写此摘要