当x失活来时,存在大量的研究。尽管是其中之一最佳学习的表观遗传现象,X染色体灭活(XCI)引发后的分子决策过程仍然远非完全理解。长期非编码RNA的调节XIST.启动XCI。XIST.“反义伙伴和压缩机tsix.被认为调节其中X染色体在每个细胞中灭活的选择。tsix.最初是双层表示的,但随后在无效x上变得沉默,允许XIST.传播和灭活该副本。因此,了解从双层elic的过渡到单方面的调节tsix.表达是了解XCI的关键。
表征与低水平表达的RNA相互作用的蛋白质,如tsix.,大多数RNA蛋白质技术都非常具有挑战性。现有的RNA蛋白质相互作用方法通常依赖于紫外线交联,这不是非常有效的,并且对于许多RNA的低水平而不是足够的敏感性,即XCI的那些。谢天谢地,Jeannie Lee的实验室在哈佛医学院为此开发了一种新技术。他们调整了生物,一种使用生物素连接酶(Bira)与与感兴趣的蛋白质密切相关的生物素蛋白蛋白的技术。为了使其适应RNA,作者将Bira融合给接头蛋白 - 噬菌体PP7涂层蛋白(PP7CP) - 然后通过插入PP7 RNA茎环基序将其纳入感兴趣的RNA。他们称之为Biorbp方法。
在这里他们发现了什么:
- Biorbp确定富含转录和染色质相关功能的蛋白质tsix.- 小鼠胚胎茎(ES)细胞中的蛋白质
- 这包括DCP1A,据信调节RNA稳定性的RNA沉积酶
- 在核仁中,DCP1A结合tsix.并控制它的稳定性
- knockDCP1A导致X-X对的累积(即一个x未被灭活)并阻止过渡到单边tsix.表达
- 使用CRISPR-CAS9,它们在每个CAS中插入特定标签tsix.等位基因在缺乏DCP1A表达的鼠标ES细胞系中,发现瞄准每个tsix.退化的等位基因导致上调CIS中的XIST.(在那种染色体上)
- 最后,他们调查了CTCF绑定的角色,以删除tsix.鉴于X-X配对中心的Biorbp实验中的含义:
- 他们发现了tsix.RNA招募CTCF到配对中心和持久性tsix.RNA可防止CTCF接合其DNA靶标
- 他们提出了一种模型,其中DCP1a降级tsix.未来无效X的RNA使CTCF结合染色质,然后沉默tsix.等位基因在CIS中启用XIST.上调。
这些新的结果进一步了解XCI期间RNA-蛋白质相互作用的作用。除了这些问题之外,Biorbp也可能在其他情况下使用。许多发育方案涉及在少数细胞中在非常低的水平下表达的RNA,Biorbp可以提供研究这些现象的方法。
所以把你的帽子脱掉了这个复杂的机制自然细胞生物学,2020年8月。